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提速近10倍！基于深度学习的全基因组选择新方法来了******

　　近日，中国农业科学院作物科学研究所、三亚南繁研究院大数据智能设计育种创新团队联合多家单位提出利用植物海量多组学数据进行全基因组预测的深度学习方法, 可以实现育种大数据的高效整合与利用，将助力深度学习在全基因组选择中的应用，为智能设计育种及平台构建提供有效工具。相关研究成果发表在《分子植物（Molecular Plant）》上。

　　全基因组选择作为新一代育种技术，通过构建预测模型，根据基因组估计育种值进行早期个体的预测和选择，从而缩短育种世代间隔，加快育种进程，节约成本，推动现代育种向精准化和高效化方向发展。

　　统计模型作为全基因组选择的核心，极大地影响了全基因组预测的准确度和效率。传统预测方法基于线性回归模型，难以捕捉基因型和表型间的复杂关系。

　　相较于传统模型，非线性模型（如深度网络神经）具备分析复杂非加性效应的能力，人工智能和深度学习算法为解决大数据分析和高性能并行运算等难题提供了新的契机，深度学习算法的优化将会提高全基因组选择的预测能力。

　　该研究团队以玉米、小麦和番茄3种作物的4种不同维度的群体数据为测试材料，通过创新深度学习算法框架开发了全基因组选择新方法。

　　与其他五种主流预测方法相比，该方法有以下优点： 可以利用多组学数据开展全基因组预测；算法设计中包含批归一化层、回调函数和校正线性激活函数等结构，可以有效降低模型错误率，提高运行速度；预测精度稳健，在小型数据集上的表现与目前主流预测模型相当，在大规模数据集上预测优势更加明显；计算时间与传统方法相近，比已有深度学习方法提速近10倍；超参数调整对用户更加友好。

　　该研究得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金、海南崖州湾种子实验室和中国农业科学院科技创新工程等项目的支持。

学术支持

中国农业科学院作物科学研究所

记者

宋雅娟

柯文哲提前从台大医学院退休，岛内媒体纷纷猜测******

　　【环球时报综合报道】前台北市长柯文哲去年年底卸任后，重返台大医学院任教，但办理了2月提前退休，1月31日是他最后一天到台大医学院上班的日子。

　　据台湾联合新闻网1月31日报道，柯文哲当天清晨7时从家里出发，步行到台大医学院上班。他表示，最近回去上班，发现和8年前离开时比起来，不知是不是因为医生怕被告才做这么多检查，“一看就知道健保(医疗保险)费没办法控制”。

　　岛内媒体普遍猜测，卸下台北市长身份、重返台大医学院任教又提前办理退休，柯文哲将全部投入到民众党主席的身份，备战2024年的台湾地区领导人以及“立委”选举。前民进党“立委”沈富雄1月28日爆料，他曾在民众党组党前和柯文哲单独吃过饭，发现柯2024年非选不可，但可以理解柯为了民众党生存等因素，确实有必选压力。不过美丽岛电子报董事长吴子嘉认为，对于2024年选举，民进党不可能和柯文哲合作，柯文哲只能选择是否与在野联盟合作。

　　台湾中时电子报评论称，春节期间逢庙必拜的民进党主席赖清德，面对2024年选举展现“旺盛企图心”，但在20岁至29岁选民间获得压倒性支持的柯文哲，一旦坚持参选到底，势必让民进党的年轻人支持度雪上加霜。台湾《中国时报》1月30日称，柯文哲是最早喊出参加2024年选举的政党人物，无奈首场地方选举成绩不理想，党内人才不断出走、地方组织薄弱都是民众党急需正视的问题，而柯文哲对内表明不当副手，未来白色阵营如何重整旗鼓，成为蓝绿两强争斗下的另类看点。民众党秘书长周台竹坦言，柯文哲过去重心放在台北市政府，从台大退休后专职党务，才是民众党重整的真正开始。周台竹同时透露，柯文哲规划访美，拜会美国政府、国会、智库及军工产业四大机构，时间在四五月，同时也不排除访问日本、新加坡等国家。(张若)

　　(环球时报)

　　（文图：赵筱尘 巫邓炎）